プログラムを使って複数のファイルにパスワードをかける方法をお探しですね。

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ユーザー登録が必要ですが、メジャーな所ではこちらとなります。

●クジラ飛行机「仕事に役立つJavaScript入門」 – 100個以上あるExcelファイルへ一気にパスワードをかける（第4回）：ITpro
http://itpro.nikkeibp.co.jp/pc/article/column/20101201/1028886/

キーワードを変えてよく探すと他にもありそうですが。

お手軽なのはZIP圧縮時にパスワードを付ける事でしょうか。

フリーソフトを探す方法もあります。

C言語でガリガリ作ってもいいですね。

ただ暗号化するソフトと復号化するソフトが一緒でないといけないですし、暗号化は面倒ですね。

1ビット化けたら終わりですし。

ZIPがお手軽でいいんじゃないでしょうか。

本物の機密情報は必要になったらその時に考えましょう。

パスワードも特殊文字を含めて長くすると破れなくなります。

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